Ha salido otra nueva versión de este programa de links directos, tiene muchas mejoras, por lo tanto es recomendable el cambio.Sobre todo bastante más estabilidad, ya no se cuelga tanto, en general mejor.
Recuerdo:
Para ejecutarlo, como siempre, primero descomprimir el paquete, tener instalado java($ sudo aptitude install java6-runtime), ir a la carpeta mediante la consola con cd y ejecutar java -jar JDownloader.jar
Descarga